自从1886年早期质谱仪器常用的离子源被Goldstein发明出来，一直到1942年di一台单聚焦质谱仪商品化，质谱大体上处在理论发展阶段。在此以后，由于发展和完善的电离技术以及分析技术，使质谱非常快地在地质、空间研究、环境化学、有机化学、制药等多个领域得到应用。

常用下列三种生物质谱技术：

1、串联质谱(MS/MS)串联质谱

串联质谱(MS/MS)串联质谱法能够不需要分开各组而对混合物中的某个组分面进行有选择性的分析。di一级质量分析器使所有组分的分子离子峰母离子获得，利用质量过逃器将需进一步分析的母离子挑出。在碰推室内此母离子由于高流速情性气体碰撞诱导离解而使碎片离子(子离子)产生。子离子往第二级质量分析器进入而使得母离子的碎片峰获得。多肽和蛋白质的结构信息能够利用对母离子和子离子的裂解关系而获得。

2、电喷雾离子化质谱

质谱进样端的毛细管柱流出的液滴在高电压的作用下带电，液滴溶剂在逆向氮气气流的作用下蒸发，表面也缩小，表面电荷密度持续变大，液滴爆裂成带电的子液滴，持续重复这一过程使zui后的液滴十分细小并且呈喷雾状，此时液滴表面有着相当强大的电压使分析物电离并通过单电荷或多电荷离子的形式往质量分析器中进入。此化合物带不同电荷的一系列质荷比峰由质谱峰显示了出来。按照软件计算能够转换成带单电荷的分子离子峰。此技术能够对fmolamol量级的样品进行分析。

3、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱

将小分子基质(肉桂酸、芥子酸及其衔生物)以及样品混合共结晶，当紫外激光(337nm)对晶体进行照射的时候，样品与基质分子由于基质分子吸收能量而解吸并电离。在加速电场的作用下，样品产生的离子获得的动能相同，经过一个真空无电场飞行管道，比较轻的离子有着比较快的速度，到达检测器也就比较早，比较重的离子到达检测器比较晚。飞行时间与(m/z)成正相关。MALDI产生的离子大部分为单电荷离子，质谱图中的谱峰与样品各组分的质量数的关系一一对应，所以MALD-MS对于蛋白质水解后的肽混合物的分析zui为合适。使这种仪器成为如今zui高灵敏度的质谱仪，对分析微量样品较为适合。